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使用酶标仪测定RNA浓度和纯度,这些要点要知道

2023-12-27

1、全波段酶标仪开机预热20min;

2、设定紫外波长 260nm,向96孔板中加入 50ul ddH2O,放入样品室的池架上,校零;

3、将待测样品稀释(RNA 5ul用ddH2O稀释至50μl)混匀后,记录编号和稀释倍数;

4、把混匀的待测样品移入干净的比色皿中,放进样品室的架上,记录稳定的OD260(A260)的值;

5、以同样的方式测待测样品在280nm下的OD值;

6、计算待测样品的浓度与纯度:

RNA样品的浓度(ng/μl)=OD260×稀释倍数×40;

纯度=OD260/OD280



举例说明

某客户某一组样品RNA测得OD260=1.016Abs,OD280=0.533Abs

根据计算公式可得:

RNA浓度  1.016×40×10=406.4 ng/ul     

RNA纯度  1.016/0.533=1.906

此浓度和纯度均适合做PCR。


问题分析

1)蛋白质污染:确保不要吸入中间层及有机相。减少起始样品量,确保裂解完全、彻底。加入氯仿后首先要充分混匀,并且离心分层的离心力和时间要足够。如果所得RNA的OD260/OD280比值偏低,则用氯仿重新抽提一次,再沉淀,溶解。

2)苯酚残留:确保不要吸入中间层及有机相。加入氯仿后首先要充分混匀,并且离心分层的离心力和时间要足够。

3)多糖或多酚的残留:一些特殊的组织和植物中,多糖、多酚含量较多,这些残留也会导致OD260/OD280比值偏低。因此,从这类材料中提取RNA时,需要注意多糖、多酚杂质的去除。

4)设备限制:测定OD260及OD280数值时,要使OD260读数在0.1-0.5之间,此范围线性最好。用水稀释样品:测OD值时,对照及样品稀释液请使用10 mM Tris,pH7.5。用水作为稀释液将导致比值偏低。


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